MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 1

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007615	T	7	7	90	96	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007615	A	6	6	97	102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007615	A	6	6	280	285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007615	AAT	2	6	302	307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007615	TTCTT	2	10	338	347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007615	AT	3	6	363	368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007615	AAC	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007615	AAGA	2	8	443	450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007615	CT	3	6	472	477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007615	AAG	2	6	512	517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007615	A	6	6	547	552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007615	ATC	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007615	CA	3	6	638	643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007615	GTCA	2	8	656	663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007615	ACTA	2	8	668	675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007615	AGA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007615	A	6	6	741	746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007615	TGC	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007615	A	7	7	2814	2820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007615	A	6	6	2824	2829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007615	TTG	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007615	GTT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007615	GGT	2	6	2906	2911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007615	AAC	2	6	2925	2930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007615	TCA	2	6	2932	2937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007615	GCAAT	2	10	2954	2963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007615	GCA	2	6	2985	2990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007615	AGA	2	6	3018	3023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007615	CGC	2	6	5207	5212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007615	TA	3	6	5225	5230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007615	ATA	2	6	5904	5909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007615	TAT	2	6	5912	5917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007615	GCAA	2	8	5928	5935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007615	A	6	6	5934	5939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007615	GGA	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007615	CGA	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007615	GCTGGA	2	12	5965	5976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007615	ATC	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007615	GGGTG	2	10	6916	6925	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007615	AGG	2	6	6997	7002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007615	CGC	2	6	8873	8878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007615	GAG	2	6	8900	8905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007615	AGCA	2	8	8933	8940	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007615	CTA	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007615	TAG	2	6	9030	9035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007615	GT	3	6	10040	10045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007615	GGC	2	6	10061	10066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007615	CGA	2	6	10157	10162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007615	GCT	2	6	10222	10227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007615	AT	3	6	10271	10276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007615	GGA	2	6	10289	10294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007615	GGT	2	6	10301	10306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007615	GGA	2	6	10312	10317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007615	TTAA	2	8	10335	10342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007615	TA	3	6	10372	10377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007615	TAAA	2	8	10426	10433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007615	ATTT	2	8	10438	10445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007615	AAG	2	6	10470	10475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007615	GCT	2	6	10588	10593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007615	TATT	2	8	10636	10643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007615	ATC	2	6	10778	10783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007615	ATT	2	6	10835	10840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007615	TTC	2	6	10879	10884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007615	TCA	2	6	10891	10896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007615	GGC	2	6	15749	15754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007615	TTG	2	6	15791	15796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007615	CTC	2	6	16480	16485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007615	T	6	6	16541	16546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007615	A	6	6	16587	16592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.